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PredictProtein - [Output Example]
PFRMAT AL
TARGET query
AUTHOR AGAPE-0.3
METHOD automatic alignment by AGAPE
MODEL 1
SCORE 4.572e-08
PARENT 1jhf_A
REMARK SCORE 4.572e-08
K 13 K 2 
K 14 A 3 
L 15 L 4 
N 16 T 5 
D 17 A 6 
R 18 R 7 
Q 19 Q 8 
R 20 Q 9 
K 21 E 10 
V 22 V 11 
L 23 F 12 
Y 24 D 13 
C 25 L 14 
I 26 I 15 
V 27 R 16 
R 28 D 17 
E 29 H 18 
Y 30 I 19 
I 31 S 20 
E 32 Q 21 
N 33 T 22 
K 34 G 23 
K 35 M 24 
P 36 P 25 
V 37 P 26 
S 38 T 27 
S 39 R 28 
Q 40 A 29 
R 41 E 30 
V 42 I 31 
L 43 A 32 
E 44 Q 33 
V 45 R 34 
S 46 L 35 
N 47 G 36 
I 48 F 37 
E 49 R 38 
S 51 S 39 
S 52 P 40 
A 53 N 41 
T 54 A 42 
I 55 A 43 
R 56 E 44 
N 57 E 45 
D 58 H 46 
M 59 L 47 
K 60 K 48 
K 61 A 49 
L 62 L 50 
E 63 A 51 
Y 64 R 52 
L 65 K 53 
G 66 G 54 
Y 67 V 55 
I 68 I 56 
Y 69 E 57 
Q 70 I 58 
P 71 V 59 
H 72 S 60 
T 73 G 61 
S 74 A 62 
A 75 S 63 
G 76 R 64 
R 77 G 65 
I 78 I 66 
P 79 R 67 
T 80 L 68 
D 81 L 69 
K 82 Q 70 
G 83 E 71 
L 84 E 72 
R 85 E 73 
F 86 E 74 
Y 87 G 75 
Y 88 L 76 
E 89 P 77 
E 90 L 78 
M 91 V 79 
L 92 G 80 
K 93 R 81 
I 94 V 82 
S 95 A 83 
K 96 A 84 
E 97 Q 92 
T 98 H 93 
S 99 I 94 
E 100 E 95 
A 101 G 96 
D 102 H 97 
L 103 Y 98 
A 104 Q 99 
V 105 V 100 
E 106 D 101 
T 107 P 102 
F 108 S 103 
K 109 L 104 
S 110 F 105 
M 111 K 106 
P 112 P 107 
L 113 N 108 
A 114 A 109 
D 115 D 110 
P 116 F 111 
E 117 L 112 
K 118 L 113 
V 119 R 114 
L 120 V 115 
F 121 S 116 
L 122 G 117 
A 123 M 118 
G 124 S 119 
N 125 M 120 
L 126 K 121 
L 127 D 122 
A 128 I 123 
R 129 G 124 
L 130 I 125 
T 131 M 126 
E 132 D 127 
G 133 G 128 
Y 134 D 129 
V 135 L 130 
L 136 L 131 
I 137 A 132 
E 138 V 133 
R 139 H 134 
P 140 K 135 
T 142 T 136 
R 143 Q 137 
D 144 D 138 
L 145 V 139 
K 146 R 140 
I 147 N 141 
L 148 G 142 
R 149 Q 143 
V 150 V 144 
M 151 V 145 
L 152 V 146 
I 153 A 147 
P 154 R 148 
V 155 I 149 
S 156 D 150 
E 157 D 151 
D 158 E 152 
Y 159 V 153 
L 160 T 154 
I 161 V 155 
F 162 K 156 
S 163 R 157 
I 164 L 158 
L 165 K 159 
T 166 K 160 
E 167 Q 161 
F 168 G 162 
G 169 N 163 
V 170 K 164 
S 171 V 165 
K 172 E 166 
V 173 L 167 
T 174 L 168 
P 175 P 169 
TER
PARENT 1kl9_A
REMARK SCORE 6.61538e-03
I 176 D 83 
K 177 L 84 
T 178 S 85 
Q 179 K 86 
E 180 R 87 
R 181 R 88 
L 182 V 89 
N 183 S 90 
W 184 P 91 
E 185 E 92 
E 186 E 93 
I 187 A 94 
E 188 I 95 
R 189 K 96 
Q 190 C 97 
L 191 E 98 
N 192 D 99 
F 193 K 100 
L 194 F 101 
L 195 T 102 
R 196 K 103 
G 197 S 104 
R 198 K 105 
T 199 T 106 
V 200 V 107 
G 201 Y 108 
E 202 S 109 
V 203 I 110 
L 204 L 111 
M 205 R 112 
G 206 H 113 
K 207 V 114 
I 208 A 115 
E 209 E 116 
S 210 V 117 
L 211 L 118 
K 212 K 122 
G 213 D 123 
S 214 E 124 
G 215 Q 125 
F 216 L 126 
L 217 E 127 
R 218 S 128 
L 219 L 129 
I 220 F 130 
E 221 Q 131 
S 222 R 132 
L 223 T 133 
I 224 V 136 
G 225 F 137 
E 226 D 138 
T 227 D 139 
V 228 K 140 
E 229 Y 141 
R 230 K 142 
Y 231 R 143 
L 232 P 144 
D 233 G 145 
A 234 Y 146 
G 235 G 147 
L 236 A 148 
E 237 Y 149 
N 238 D 150 
L 239 A 151 
L 240 F 152 
K 241 K 153 
D 242 H 154 
E 243 A 155 
T 244 V 156 
L 245 S 157 
T 246 D 158 
L 247 P 159 
E 248 S 160 
D 249 I 161 
I 250 L 162 
R 251 D 163 
N 252 S 164 
L 253 L 165 
L 254 D 166 
E 255 L 167 
E 256 N 168 
V 257 E 169 
K 258 D 170 
D 259 E 171 
Q 260 R 172 
K 261 E 173 
F 262 V 174 
L 263 L 175 
E 264 I 176 
S 265 N 177 
L 266 N 178 
V 267 I 179 
G 268 N 180 
TER
PARENT 1kp8_A
REMARK SCORE 3.82516e-02
E 269 G 297 
G 270 G 298 
I 271 T 299 
T 272 V 300 
V 273 I 301 
R 274 S 302 
I 275 I 305 
G 276 G 306 
R 277 M 307 
E 278 E 308 
I 279 L 309 
G 280 E 310 
R 281 K 311 
K 282 A 312 
K 283 T 313 
L 284 L 314 
E 285 E 315 
K 286 D 316 
F 287 L 317 
A 288 G 318 
V 289 Q 319 
F 290 A 320 
G 292 K 321 
K 293 R 322 
Y 294 V 323 
F 295 V 324 
K 296 I 325 
G 297 N 326 
E 298 K 327 
S 299 D 328 
P 300 T 329 
I 301 T 330 
G 302 T 331 
S 303 I 332 
V 304 I 333 
Y 305 D 334 
L 306 G 335 
F 307 V 336 
T 308 G 337 
K 313 E 338 
Y 314 E 339 
D 315 A 340 
R 316 A 341 
N 317 I 342 
H 318 Q 343 
R 319 G 344 
V 320 R 345 
F 321 V 346 
E 322 A 347 
Y 323 Q 348 
I 324 I 349 
L 325 R 350 
N 326 Q 351 
R 327 Q 352 
L 328 I 353 
S 329 E 354 
E 330 E 355 
Y 331 A 356 
F 332 T 357 
T 333 S 358 
S 334 D 359 
T 335 Y 360 
S 336 D 361 
R 337 R 362 
R 338 E 363 
TER
END

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